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能源工业的微生物检测分离和测量微生物有一个更好的方法。在冷却塔中,追踪细菌不仅仅是微生物的生长——你要追踪风险和测量效率。这些都是能源工业的基本任务,但它们本质上也是无休止的。这是个机会。一种更快、更低成本地分离和测量微生物的方法,将使月复一月的回报成倍增长。你会节省时间,节省金钱,提高成绩。无限期的。快速微生物检测。RAN 生物技术公司的利工艺简单,成本低廉,而且可以在数小时而不是数天内得到可靠的数值结果。我们的两步手持测试正在改变能源工业追踪微生物的方式。你只需要花一点时间自己测试一下。此外,如果需要,可以扩大检测范围,以确定检测到的微生物。
用于单细胞图解研究的人肠组织的解离和 inDrops 微流体封装 Alan J Simmons 1,Ken S Lau 2 Affiliations expandPMID: 35880121 PMCID: PMC9307676 DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101570 Free PMC article leAbstractIn 基于液滴的单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)实验,将细胞连同其周围的一些缓冲液和环境材料封装成液滴用于 mRNA 捕获和条形码。该方案详细说明了使用冷活性蛋白酶进行人体肠道组织解离的步骤,以及随后分离单个上皮细胞,通过洗涤富集活力。接下来,描述了在 inDrops scRNA-seq 平台上封装的步骤。该方法已被证明适用于息肉、癌症和发炎组织。关于该方案的使用和执行的完整细节,请参阅 Chen 等人(2021)。关键词: RNAseq; 单细胞。2022作者。利益冲突声明作者声明没有相互竞争的利益。
环境研究用于环境研究的微生物分离和检测知道水中有什么变得越来越容易。从海洋研究到生物医学再到野生动物研究,环境研究人员必须尽可能多地了解他们所研究的世界,才能产生新的发现。微生物的分离和检测是一个不可少的环节。但是传统的培养皿方法需要几天才能得到结果。 RMD 做得更快,更经济,并且具有同样或更多的准确性。快速微生物检测的核心创新是一种智能亲和色谱法纳米材料,可以捕捉和分离样本中的微生物。结果是可视的和数字化的,但测试可以用小型设备在现场进行。结果需要几个小时,甚至几分钟。这种转变正在改变研究的方式,你只需要花一点时间亲自尝试一下。
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全球流行的绝大多数病原体未被发现,影响了病人的护理,阻碍了疫情的准备和反应。为了能够进行常规监测和全面的诊断应用,需要能够扩大测试许多样品的检测技术1,2,3,同时测试许多病原体4,5,6。在这里,我们开发的组合阵列反应多重评价核酸(CARMEN) ,一个可扩展的平台,多重病原体检测。在 CARMEN 平台中,含有基于 CRISPR 的核酸检测试剂7的纳升液滴在微孔阵列中自组织8与扩增的样品液滴配对,重复测试每个样品针对每个 CRISPR RNA (crRNA)。CARMEN 和 Cas13检测(CARMEN-Cas13)的组合能够在单个阵列上对超过4,500个 crRNA 靶对进行强有力的检测。使用 CARMEN-Cas13,我们开发了一种多重测定法,可以同时区分至少10个已发表基因组序列的所有169种人类相关病毒,并快速加入另外的 crRNA 以检测2020年2019冠状病毒疾病大流行的病原体。CARMEN-Cas13进一步实现了甲型流感病毒株的全面分型和几十种 HIV 耐药突变的多重鉴定。CARMEN 的内在复用和吞吐能力使其具有可扩展性,因为小型化使每次测试的试剂成本降低了300多倍。可扩展的,高度复用的基于 CRISPR 的核酸检测将诊断和监测工作从高优先级样品的有针对性测试转移到大样本集的综合测试,极大地有利于患者和公共卫生9,10,11。
主要传染病是对人类健康和全球安全的一些最大威胁,然而,对于绝大多数致病微生物,目前还没有广泛可用的分子检测方法,这限制了它们的诊断和监测。在许多能够感染人类的病毒物种中(其中576个已经测序,其中169个在2018年10月之前至少有10个已发表的基因组12) ,只有39个具有经 FDA (美国食品和药物管理局)批准的诊断。虽然已经开发了实验室开发的测试,用于在特定设施对不同的病原体进行临床测试,但这些测试可能周转时间很长,而且很少复用。常规的综合诊断检测将提供以前无法获得的数据流,通知患者、医护人员和政策制定者抑制和减轻疾病暴发。然而,由于缺乏可扩展和多路复用的技术来快速廉价地鉴定任何循环病原体,这些工具并不普遍可用(图1a)。通过测序或微阵列杂交进行全面的疾病检测提供了关于病原体基因型和进化的详细信息,但由于样品制备的成本和后勤需求,难以大规模实施4,5,6,13。快速,低成本的检测方法,如基于 CRISPR 的方法,基于抗原的检测,PCR 或环介导的等温扩增(LAMP) ,在给定的反应中仅检测一种或少量的病原体1,2,3,7,14,15,16。结合这些方法的优点,一个理想的诊断和监测技术将是高度多元化和容易规模跨数百个样本。
在人类和动物群体中鉴定多种循环病原体是一个大规模的检测问题。CARMEN-Cas13工作流程示意图。C,寨卡 cDNA 通过具有原子摩尔敏感性的单一 CARMEN-Cas13测定和数十个重复液滴对(黑点,重复数量为蓝色)检测; 红线显示中位数并用于构建下面的热图。顶部,有代表性的水滴图像。AU 任意单位。
微型化和自组织微流体技术使生物化学和细胞分析的大规模复用成为可能[17,18,19,20,21]。我们最近开发了一个微孔阵列系统,利用微型化和自我组织进行全面的组合实验。在这个系统中,用户准备一组输入作为液滴乳剂,输入液滴在阵列的井中组织自己,创建所有可能的成对组合,而不需要额外的用户努力或主动仪器8。我们设想基于 CRISPR 的核酸检测可以与微孔阵列系统相结合,并行测试多个扩增样品的多个分析物。
为了实现高度复用的核酸检测,我们开发了 CARMEN (图1b,扩展数据图1)。CARMEN-Cas13的输入是通过 PCR 或重组酶聚合酶扩增(RPA)和 Cas13检测混合物扩增的样品,其含有 Cas13,序列特异性 CRISPR RNA (crRNA)和切割报告基因7(扩展数据图1)。每个放大样品或检测混合物在传统的微量滴定板中制备,并与作为光学标识符的特的基于溶液的荧光色码结合。每种颜色编码的溶液在含氟油中乳化,得到1-nl 的液滴。一旦乳化,来自所有样品和检测混合物的液滴汇集到一个单管中,并且ーー在一个移液步骤中ーー装载到由聚二甲基硅氧烷(PDMS)模制的微孔阵列芯片中(图1b,扩展数据图1,2)。阵列中的每个微孔随机容纳来自池的两个液滴,从而自发形成液滴化输入的所有成对组合,并且阵列密封在玻璃基板上以物理隔离每个微孔。通过使用荧光显微镜鉴别液滴的颜色代码来确定每个微孔的含量。暴露在电场中会合并每个微孔中的液滴对,并同时启动所有的检测反应。荧光显微镜用于监测每个检测反应(图1b,扩展数据图1,2)。
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